1960 erlangte die Insel die Unabhängigkeit von Frankreich. Der junge Staat wurde von der Schweiz umgehend anerkannt. 1961 nahmen die beiden Länder diplomatische Beziehungen auf.
In den ersten Jahren der Unabhängigkeit unterhielt die Schweiz in Antananarivo ein Generalkonsulat. Später eröffnete sie eine Botschaft, die lange von einem Geschäftsträger geleitet wurde. Seit 2007 verfügt sie über einen residierenden Botschafter.
1998 schloss die DEZA ihr Kooperationsbüro in Antananarivo. Drei Jahre später startete sie ein Spezialprogramm, das sich auf gute Regierungsführung und die Förderung der lokalen Wirtschaft konzentriert und seit 2013 in neuer Form weitergeführt wird.
Madagaskar, Historisches Lexikon der Schweiz
Diplomatische Dokumente der Schweiz, Dodis