Le DFAE coopère et soutient avec son savoir-faire les autres départements fédéraux dans des domaines importants de la politique étrangère. 

Le rôle du DFAE est d’assurer une défense optimale des intérêts de la politique extérieure de la Suisse. Le DFAE coopère ainsi avec d’autres départements pour assurer une présence active de la Suisse dans les relations internationales ainsi qu’un droit de codécision dans les principales enceintes multilatérales. Il participe également à l’élaboration de règles et de standards internationaux. Enfin, il veille à la cohérence et à la bonne coordination des positions défendues par la Suisse. En ayant une vue d’ensemble de la politique étrangère, le DFAE peut pondérer les intérêts et identifier les possibilités de concessions entre les secteurs.